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Tous les champignons ont-ils des cellules similaires ?

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Je sais que la plupart des champignons ne se différencient pas en tissus. Et les tissus sont des groupes de cellules spécialisées visant à remplir une fonction collective. S'ensuit-il alors que la plupart des champignons n'ont pas de cellules distinctes pour des fonctions distinctes, et que toutes leurs cellules sont essentiellement les mêmes ? Je suis un peu sceptique à l'idée d'arriver à cette conclusion ; mais si c'est vrai, alors je crois qu'il serait raisonnable de dire qu'il n'y a pas de différence entre les cellules qui donnent naissance à des spores et celles qui n'en produisent pas. Comment est-il possible, cependant, que les cellules soient structurellement similaires mais capables d'effectuer des tâches différentes ?

Pour résumer,

  1. Les champignons sans tissus n'ont-ils pas de cellules différentes et sont-ils tous exactement les mêmes à tous égards ? Je pense que la réponse à cette question serait également applicable à d'autres organismes multicellulaires.

  2. Est-il possible que deux cellules structurellement similaires chez les champignons soient aptes à deux tâches différentes ? Cela semble également être extensible pour incorporer tous les autres organismes multicellulaires.


  • Les premiers chytrides reconnaissables sont apparus il y a plus de 500 millions d'années à la fin de la période précambrienne.
  • Comme les protistes, les chytrides vivent généralement dans des environnements aquatiques, mais certaines espèces vivent sur terre.
  • Certains chytrides sont des saprobes tandis que d'autres sont des parasites qui peuvent être nocifs pour les amphibiens et autres animaux.
  • Les chytrides se reproduisent à la fois sexuellement et asexuée, ce qui conduit à la production de zoospores.
  • Les chytrides ont de la chitine dans leurs parois cellulaires, un groupe unique contient également de la cellulose avec de la chitine.
  • Les chytrides sont pour la plupart unicellulaires, mais il existe des organismes multicellulaires.
  • chytridiomycète: un organisme du phylum Chytridiomycota
  • zoospore: une spore asexuée de certaines algues et champignons
  • flagelle: un flagelle est un appendice en forme de cil qui dépasse du corps cellulaire de certaines cellules procaryotes et eucaryotes
  • cénocytaire: une cellule multinucléée qui peut résulter de plusieurs divisions nucléaires sans leur cytokinèse associée

1) Les champignons peuvent guérir la maladie

Beaucoup peuvent être familiers avec l'antibiotique connu sous le nom de pénicilline. Saviez-vous qu'il a été produit à partir d'une moisissure qui est un champignon ? Vers 1929, un médecin de Londres, en Angleterre, écrivit un article sur ce qu'il appelait la « pénicilline », dérivée de la moisissure Penicillium notatum (maintenant connue sous le nom de Penicillium chrysogenum). Il avait la capacité de tuer les bactéries. Sa découverte et ses recherches ont déclenché une chaîne d'événements qui conduiraient au développement de nombreux antibiotiques qui sauveraient d'innombrables vies. De même, l'antibiotique cyclosporine est un immunosuppresseur clé et est utilisé dans les greffes d'organes.


Nutrition fongique : saprobes, parasites et mutualistes

Un thalle fongique peut être aussi petit qu'une seule cellule microscopique (levure de boulanger, Saccharomyces cerevesiae ) ou excessivement grand ( Armillaria gallica, le champignon géant de plusieurs acres signalé en 1992 comme le plus grand organisme au monde). Le sporocarpe (corps du fruit ou taille de « champignon ») varie également de microscopique à des mètres de diamètre ( Bridgeoporus nobilissimus, un champignon de support en voie de disparition trouvé sur les sapins nobles).

Sans surprise, un royaume aussi diversifié manifeste plusieurs cycles de vie différents. Pratiquement tous les champignons produisent des spores. Les spores asexuées et sexuées peuvent germer pour former des thalles végétatifs à partir des mycéliums primaires et secondaires. Les thalles peuvent être haploïde dominant, diploïde dominantes, ou présentent une alternance haplo-diploïde de générations. Ici, il est important de ne pas confondre l'état chromosomique des noyaux individuels (haploïde versus diploïde) avec le nombre de noyaux par cellule (monokartyotique versus dicaryotique). Les champignons sont inhabituels en ce qu'ils présentent souvent une dicaryotamie, dans laquelle les cellules hyphales contiennent deux noyaux (généralement haploïdes) qui migrent, se multiplient et se divisent ensemble.

Même si superficiellement tout comme les plantes, les champignons sont probablement plus étroitement liés aux animaux. Comme les animaux, les champignons manquent de chlorophylle et ne font pas de photosynthèse, doivent obtenir des nutriments à partir de sources organiques et stocker de l'énergie sous forme de glycogène au lieu d'amidon. Contrairement aux animaux, cependant, les champignons n'engloutent pas, mais absorbent plutôt, leurs nutriments après les avoir décomposés via enzymatique action, ce qui leur a valu le surnom de ⊫sorbotrophs."

Les champignons absorbent leurs nutriments de trois manières différentes : (1) les saprobes décomposent la matière organique morte (2) parasites se nourrissent d'hôtes vivants et (3) les mutualistes vivent en union symbiotique avec d'autres organismes vivants. Champignons saprophytes, comme les champignons des prés comestibles ( Agaricus campestris ), shiitake ( Lentinules edodes ) et pleurotes ( Pleurotus ostreatus ), décomposent les tissus végétaux et animaux morts en libérant enzymes à partir des pointes des hyphes, recyclant ainsi les matières organiques dans le milieu environnant. Les champignons parasites utilisent également des enzymes pour décomposer les tissus vivants, sapant généralement l'énergie de l'hôte et provoquant fréquemment sa disparition.

Lichens et mycorhizes sont deux associations mutualistes importantes. Les lichens représentent des partenariats entre un champignon (mycobionte) et une ou plusieurs algues (phycobionte). Bien qu'il existe quelques basidiolichens, presque tous


Incompatibilité sexuelle

La plupart des champignons les plus simples produisent des organes mâles et femelles différenciés sur le même thalle, mais ne subissent pas d'autofécondation car leurs organes sexuels sont incompatibles. De tels champignons nécessitent la présence de thalles de différents types d'accouplement pour que la fusion sexuelle ait lieu. La forme la plus simple de ce mécanisme se produit chez les champignons dans lesquels il existe deux types d'accouplement, souvent désignés + et - (ou UNE et une). Les gamètes produits par un type de thalle ne sont compatibles qu'avec les gamètes produits par l'autre type. Ces champignons sont dits hétérothalliques. Cependant, de nombreux champignons sont homothalliques, c'est-à-dire que les organes sexuels produits par un seul thalle sont auto-compatibles et qu'un deuxième thalle est inutile pour la reproduction sexuée. Certains des champignons les plus complexes (par exemple, les champignons) ne développent pas plutôt des organes sexuels différenciés, la fonction sexuelle est assurée par leurs hyphes somatiques, qui unissent et rassemblent des noyaux compatibles en vue de la fusion. L'homothallisme et l'hétérothalisme sont rencontrés chez les champignons qui n'ont pas développé d'organes sexuels différenciés, ainsi que chez les champignons dans lesquels les organes sexuels sont facilement distinguables. La compatibilité renvoie donc à une différenciation physiologique, et le sexe renvoie à une différenciation morphologique (structurelle) les deux phénomènes, bien que liés, ne sont pas synonymes.


Des chercheurs développent un algorithme pour comparer les cellules d'une espèce à l'autre

Les cellules sont les éléments constitutifs de la vie, présentes dans chaque organisme vivant. Mais à quel point pensez-vous que vos cellules sont similaires à celles d'une souris ? Un poisson? Un ver?

La comparaison des types cellulaires de différentes espèces à travers l'arbre de vie peut aider les biologistes à comprendre comment les types cellulaires sont apparus et comment ils se sont adaptés aux besoins fonctionnels des différentes formes de vie. Cela a suscité un intérêt croissant pour les biologistes de l'évolution ces dernières années, car les nouvelles technologies permettent désormais de séquencer et d'identifier toutes les cellules d'organismes entiers. "Il y a essentiellement une vague dans la communauté scientifique pour classer tous les types de cellules dans une grande variété d'organismes différents", a expliqué Bo Wang, professeur adjoint de bio-ingénierie à l'Université de Stanford.

En réponse à cette opportunité, le laboratoire de Wang a développé un algorithme pour relier des types de cellules similaires sur des distances évolutives. Leur méthode, détaillée dans un article publié le 4 mai dans eLife, est conçu pour comparer les types cellulaires de différentes espèces.

Pour leurs recherches, l'équipe a utilisé sept espèces pour comparer 21 appariements différents et a pu identifier les types de cellules présents dans toutes les espèces ainsi que leurs similitudes et leurs différences.

Selon Alexander Tarashansky, un étudiant diplômé en bio-ingénierie qui travaille dans le laboratoire de Wang, l'idée de créer l'algorithme est venue un jour où Wang est entré dans le laboratoire et lui a demandé s'il pouvait analyser les ensembles de données de type cellulaire de deux vers différents que le laboratoire étudie à le même temps.

"J'ai été frappé par la netteté des différences entre eux", a déclaré Tarashansky, auteur principal de l'article et membre interdisciplinaire de Stanford Bio-X. "Nous pensions qu'ils devraient avoir des types de cellules similaires, mais lorsque nous essayons de les analyser à l'aide de techniques standard, la méthode ne les reconnaît pas comme étant similaires."

Il s'est demandé s'il s'agissait d'un problème avec la technique ou si les types de cellules étaient tout simplement trop différents pour correspondre d'une espèce à l'autre. Tarashansky a ensuite commencé à travailler sur l'algorithme pour mieux faire correspondre les types de cellules à travers les espèces.

"Disons que je veux comparer une éponge à un humain", a déclaré Tarashansky. "Il n'est vraiment pas clair quel gène d'éponge correspond à quel gène humain car à mesure que les organismes évoluent, les gènes se dupliquent, ils changent, ils se dupliquent à nouveau. Et maintenant, vous avez un gène dans l'éponge qui peut être lié à de nombreux gènes chez l'homme. "

Au lieu d'essayer de trouver une correspondance génique un à un comme les méthodes précédentes pour la correspondance des données, la méthode de cartographie des chercheurs fait correspondre le gène de l'éponge à tous les gènes humains potentiellement correspondants. Ensuite, l'algorithme détermine lequel est le bon.

Tarashansky dit qu'essayer de trouver uniquement des paires de gènes un à un a limité les scientifiques cherchant à cartographier les types de cellules dans le passé. "Je pense que la principale innovation ici est que nous tenons compte des caractéristiques qui ont changé au cours de centaines de millions d'années d'évolution pour les comparaisons à long terme."

« Comment pouvons-nous utiliser les gènes en constante évolution pour reconnaître le même type de cellule qui change également constamment chez différentes espèces ? » a déclaré Wang, qui est l'auteur principal du document. "L'évolution a été comprise à l'aide de gènes et de traits de l'organisme, je pense que nous sommes maintenant à un tournant passionnant pour combler les échelles en examinant comment les cellules évoluent."

Remplir l'arbre de vie

En utilisant leur approche cartographique, l'équipe a découvert un certain nombre de gènes conservés et de familles de types cellulaires à travers les espèces.

Tarashansky a déclaré qu'un point culminant de la recherche était la comparaison des cellules souches entre deux vers plats très différents.

"Le fait que nous ayons trouvé des correspondances individuelles dans leurs populations de cellules souches était vraiment excitant", a-t-il déclaré. "Je pense que cela a fondamentalement débloqué beaucoup d'informations nouvelles et passionnantes sur l'apparence des cellules souches à l'intérieur d'un ver plat parasite qui infecte des centaines de millions de personnes dans le monde entier."

Les résultats de la cartographie de l'équipe suggèrent également qu'il existe une forte conservation des caractéristiques des neurones et des cellules musculaires, des types d'animaux très simples, tels que les éponges, aux mammifères plus complexes comme les souris et les humains.

"Cela suggère vraiment que ces types de cellules sont apparus très tôt dans l'évolution animale", a déclaré Wang.

Maintenant que l'équipe a construit l'outil de comparaison cellulaire, les chercheurs peuvent continuer à collecter des données sur une grande variété d'espèces à des fins d'analyse. Au fur et à mesure que de plus en plus d'ensembles de données provenant de plus d'espèces sont collectés et comparés, les biologistes seront en mesure de tracer la trajectoire des types de cellules dans différents organismes et la capacité de reconnaître de nouveaux types de cellules s'améliorera.

"Si vous n'avez que des éponges, puis des vers et que vous manquez de tout le reste, il est difficile de savoir comment les types de cellules d'éponge ont évolué ou comment leurs ancêtres se sont diversifiés en éponges et en vers", a déclaré Tarashansky. "Nous voulons remplir autant de nœuds que possible le long de l'arbre de vie pour pouvoir faciliter ce type d'analyse évolutive et le transfert de connaissances entre les espèces."


Tous les champignons ont-ils des cellules similaires ? - La biologie

Les champignons en tant qu'agents pathogènes humains

Les champignons qui sont des agents pathogènes sont généralement des champignons phytopathogènes. Il existe relativement peu d'espèces pathogènes pour les animaux, en particulier les mammifères. Selon Hawksworth (1992), il existe environ 1,5 million d'espèces de champignons décrites. Un peu plus de 400 de ces espèces sont connues pour causer des maladies chez les animaux, et beaucoup moins de ces espèces causeront spécifiquement des maladies chez les humains. Beaucoup de ces derniers ne seront que des types superficiels de maladies qui sont plus un problème cosmétique qu'un problème de santé. Ainsi, il n'y a pas beaucoup d'espèces de champignons pathogènes pour l'homme qui seront mortelles. L'étude des champignons en tant qu'agents pathogènes animaux et humains est mycologie médicale. Il existe aussi une chose telle que mycologie vétérinaire, mais les types de maladies que l'on trouve chez vos animaux de compagnie sont souvent les mêmes que ceux que l'on trouve chez les humains. En raison de la rareté des maladies humaines causées par les champignons, la plupart des gens ont peu ou pas de connaissances sur ces maladies.

Les maladies des animaux à sang chaud causées par des champignons sont appelées mycoses (sing.=mycose). Bien que ces maladies soient relativement peu nombreuses, les champignons qui les provoquent ont un large éventail d'hôtes et de zones géographiques. La plupart de ces maladies ne sont pas mortelles, mais une fois contractées, elles peuvent être à jamais une source d'irritation constante et peuvent entraîner une peur permanente, c'est pourquoi elles ne sont pas si jolies à voir.

Le traitement réussi des maladies fongiques est plus difficile que celles causées par des bactéries. Parce que les bactéries sont des procaryotes, la composition de leurs cellules est très différente de celle de nos propres cellules eucaryotes et les produits pharmaceutiques, tels que les antibiotiques, sont capables de détruire avec succès les bactéries sans endommager nos cellules, tissus et organes. Cependant, comme les champignons sont des eucaryotes, il est plus difficile de trouver un traitement qui tuera le champignon et n'endommagera pas nos propres cellules. Ainsi, la plupart des traitements chimiques sont également toxiques pour nous ainsi que pour le champignon. Le médicament le plus largement utilisé pour traiter la mycose systémique et d'autres infections fongiques qui ne répondent pas aux autres médicaments est l'amphotéricine B. Les médicaments à base d'azole sont également largement utilisés, mais ils ne font qu'inhiber la croissance fongique et ne tuent pas le champignon.

Histoire de la théorie des maladies humaines

L'histoire des maladies humaines raconte une histoire qui est parallèle et chevauche celle des maladies des plantes. Les premiers hommes considéraient la maladie comme l'œuvre des démons, et dans de nombreuses sociétés tribales, l'exorcisme des démons était le travail du chaman, du sorcier, du sorcier, etc. Avec le développement de l'agriculture et de la civilisation, des histoires plus élaborées sont apparues. Par exemple, les Grecs racontent le mythe de Pandore ouvrant une boîte que lui avait donnée Zeus et libérant une multitude de fléaux sur l'humanité. Cependant, ils ont également créé Esculape, le dieu de la guérison et de la médecine qui avait deux filles, Hygie et Panacée, qui étaient des déesses de la santé.

Au IVe siècle av. C'est la théorie de Génération spontanée, une théorie qui a survécu jusque dans les années 1800.

Dès 350 avant JC, Hippocrate a développé une théorie qui n'était pas basée sur la superstition et le mythe. Le sien Théorie humorale ont suggéré que les maladies étaient le résultat d'une relation disproportionnée entre les humeurs ou les fluides corporels : sang, bile jaune, bile noire et mucosités (salive). Pour être en bonne santé, chaque humeur corporelle doit maintenir une certaine proportion avec les autres fluides corporels. Les humeurs d'un individu peuvent devenir déséquilibrées lorsqu'ils tombent malades, avec le changement de saison, la suralimentation, etc., et l'équilibre de leurs humeurs doit être ajusté pour les ramener à l'équilibre. Les ajustements étaient souvent faits en incitant un individu à vomir ou à tirer du "mauvais sang" en coupant une artère ou une veine. Ainsi est née la pratique de saignée, qui, avec les coupes de cheveux, les rasages et les lavements, a été réalisée dans les salons de coiffure. Même aujourd'hui, les salons de coiffure utilisent encore l'affichage des poteaux à rayures rouges et blanches comme moyen de faire savoir au public qu'il s'agit d'un établissement de coupe de cheveux. Cependant, la signification de ce symbole de salon de coiffure n'a rien à voir avec la coupe de cheveux. La bande rouge sert à indiquer le sang qui est saigné, la blanche correspond au garrot utilisé pour dilater les veines.

savant romain, Marcus Terentius Varron (116BC -27BC ) soupçonnait que la maladie était causée par de petits animaux dans l'air. Cependant, en raison de l'âge des ténèbres qui a suivi, la science a peu progressé jusqu'au XVIe siècle. En 1546, Girolamo Fracastoro a donné la première description du typhus et a suggéré que cette maladie pouvait être contractée d'une personne à une autre par contact direct ou par des individus entrant en contact avec des objets inanimés appelés passif, c'est-à-dire le linge, les ustensiles de cuisine, les vêtements, etc.

En 1688, Francesco Redi, un scientifique florentin, fut le premier à contester l'idée de génération spontanée. On pensait que les asticots et les mouches survenaient spontanément, de la chair animale en décomposition. Redi a protégé la chair animale pourrie de l'air et d'autres sources d'infection visibles et a observé que les asticots et les mouches ne provenaient pas de la viande protégée. Sa conclusion était que les mouches et les asticots étaient présents dans la viande non protégée, mais absents dans la viande protégée, car elle servait de zone de nidification pour les œufs des mouches ainsi que de source de nourriture une fois les œufs éclos. Pour une description détaillée et une illustration de l'expérience de Redi, voir leçon 02.

En 1674, Anton Van Leeuwenhoek est devenu la première personne à voir et à décrire divers micro-organismes. Il continuerait à décrire les observations de tout ce qu'il pouvait placer sous le microscope jusqu'à juste avant sa mort en 1723.

Vous devez également vous rappeler que la démonstration d'Anton de Bary selon laquelle la brûlure de la pomme de terre a été causée par Phytophthora infestants est venu un an plus tôt que la théorie des germes de Pasteur. Cependant, la démonstration que les champignons pouvaient provoquer des maladies chez l'homme a même précédé de Bary. En 1835, Agostino Bassi découvert qu'une maladie des vers à soie connue sous le nom de muscardine pouvait être transféré d'un ver à soie à un ver à soie et était causé par un champignon, Beauvaria bassiana, une espèce qui fut plus tard nommée pour Bassi en l'honneur de sa découverte. Le champignon se développe sur le ver à soie, le recouvrant de mycélium blanc, le tuant finalement. Il s'agit d'un problème important dans l'industrie de la soie, car un ver à soie infecté peut propager le champignon à tous les autres vers à soie. C'est peu de temps après, en 1841, David Gruby a démontré pour la première fois qu'une infection fongique du cuir chevelu, appelée favus, a été causée par un champignon (dans Rippon, 1988). La maladie se caractérise par d'épaisses croûtes jaunes sur les follicules pileux. À une époque antérieure à l'utilisation des milieux gélosés, Gruby a isolé le champignon responsable du favus, à partir d'individus infectés, a cultivé le champignon sur des tranches de pommes de terre et a pu reproduire la maladie du favus en réalisant des expériences d'inoculation sur des tissus sains. Cette expérience a démontré, pour la première fois, qu'un micro-organisme était à l'origine d'une maladie humaine (vous vous souvenez du postulat de Koch ?). Cependant, les recherches de Gruby dans ce domaine ont été pour la plupart ignorées, peut-être en raison de forts sentiments antisémites, en médecine à cette époque (Rippon, 1988).

Connaissance lente de l'avancement de la mycologie médicale

Il semblerait qu'avec les connaissances acquises grâce aux recherches de Bassi et Gruby que dans l'étude des maladies, la connaissance des maladies fongiques aurait dû progresser plus rapidement que les maladies bactériennes. Or, ce n'est évidemment pas le cas. Les maladies bactériennes sont de loin plus connues. Plusieurs raisons expliquent cette disparité des connaissances. Par rapport aux maladies bactériennes, les maladies fongiques sont rares et bien que certains mycoses puissent être graves voire mortels, il n'y a pas eu d'épidémies de ces maladies comme celles que nous avons trouvées chez les bactéries. Par exemple, la peste bubonique était responsable d'environ un tiers de la population de l'Europe, entre 1346-1350 et 40% de la population de Constantinople, en 1542, et alors que d'autres maladies telles que la tuberculose, le paludisme, les épidémies de dysenterie n'étaient pas aussi graves, eux aussi ont causé de nombreux décès. La combinaison de la gravité, de la fréquence et des épidémies qui se sont produites dans les maladies bactériennes ont, sans aucun doute, poussé les progrès dans l'étude des maladies bactériennes. Un autre problème qui a ralenti la progression des maladies fongiques, et qu'il ne faut pas estimer, est la compréhension du concept d'espèce chez les champignons. En 1890, Sabouraud a commencé à publier un grand nombre d'articles sur les troubles fongiques de la peau qui ont finalement abouti à une énorme contribution au domaine de la mycologie médicale. Cependant, Sabouraud avait du mal à comprendre les variations dans les formes que les champignons peuvent souvent présenter. Certaines espèces de champignons peuvent prendre plusieurs formes, un phénomène connu sous le nom de pléomorphisme. Ainsi, certaines des espèces publiées de Sabouraud ainsi que celles de ses contemporains n'étaient que des formes différentes d'espèces existantes. Cela a abouti à la description de centaines d'espèces qui seraient plus tard déterminées comme représentant des espèces déjà publiées. Certaines de ces espèces étaient basées sur des observations minutieuses où seules de légères variations dans la forme du champignon étaient considérées comme représentant de nouvelles espèces, mais certaines espèces nouvellement décrites étaient également basées sur des observations inexactes et incomplètes. La complication de la nomenclature et de la classification des champignons a également ralenti les progrès. C'était un problème, à l'époque, car les médecins n'étaient formés ni à la mycologie ni aux systèmes de dénomination et de classification des organismes. Ce ne serait qu'en 1934 que les concepts d'espèces de dermatophytes seraient redéfinis par Chester Emmons, selon les règles de nomenclature botanique, et les normes mycologiques actuelles de la morphologie des spores et des structures sur/dans lesquelles elles étaient portées. Cependant, avec les moyens de produire en masse de la pénicilline au début des années 40 et la découverte d'autres antibiotiques, de nombreuses maladies bactériennes très graves étaient contrôlées. Bien que, dans une certaine mesure, il existe des moyens chimiques de contrôler certaines maladies fongiques, ils ne sont en aucun cas toujours efficaces.

De quel type de champignons parlons-nous ?

Il existe un certain nombre de maladies qui causent spécifiquement des maladies humaines. Cependant, les champignons peuvent varier dans leur spécificité d'hôte.

La majorité de la plupart des champignons pathogènes humains semblent être des espèces vivant dans le sol où ils vivent comme des saprobes, mais étant donné les conditions appropriées, c'est-à-dire si la personne n'est pas en bonne santé, une plaie ouverte est présente, une injection directe de champignon dans votre système, une vie particulière -style, SIDA, etc., ils attaqueront agressivement les gens. Ainsi, de nombreuses infections fongiques peuvent être dues à champignons opportunistes (=parasites facultatifs) plutôt que des champignons qui causent spécifiquement des maladies humaines. Par exemple Coprinus cinereus, un champignon commun a été signalé comme provoquant une endocardite (Speller et MacIver, 1970), Ustilago maydis, le charbon du maïs est connu pour provoquer des lésions cutanées (Revue par Lacaz, et al., 1996) et commune de Schizophyllum, un champignon de décomposition du bois qui a causé plusieurs types d'infections, y compris la méningite et les troubles pulmonaires (Examiné dans Kern et Uecker, 1986). Ces types de champignons peuvent être plus nocifs que les parasites obligatoires car un parasite facultatif ne dépend pas d'un organisme vivant et n'a évolué avec aucun hôte particulier, ils attaquent agressivement leurs hôtes et il y a une plus grande probabilité qu'ils tuent leurs hôtes que un parasite obligatoire. Cependant, normalement, ces types de champignons ne causent pas de mycoses humaines à moins que leur système immunitaire ne soit compromis d'une manière ou d'une autre.

Image de gauche : Coprinus cinereus, de Jason Stajich, http://farm3.static.flickr.com/2269/1904556823_950594c954.jpg. Image du milieu : Ustilago maydis. Image de droite : commune de Schizophyllum, de http://en.wikipedia.org/wiki/File:Spaltbl%C3%A4tlinge.jpg.

Nous sommes souvent en contact avec des champignons au cours de nos routines quotidiennes, certains potentiellement pathogènes pour l'homme et d'autres non. Nous pouvons être exposés simplement en marchant dans des zones de construction où le sol a été perturbé et dispersé au vent par la machinerie, nous sommes constamment exposés pendant que nous faisons de la randonnée, du jogging, de la chasse ou de la pêche. Pendant les loisirs lorsque nous nous blessons, par exemple avec une blessure par piqûre, des écorchures, des brûlures ou même par inhalation d'un grand nombre de spores nocives. Heureusement, la plupart d'entre nous avons un système immunitaire qui nous protégera contre de telles infections par des champignons, mais certaines personnes contracteront des maladies fongiques à la suite de telles blessures.

Alors, quels types de champignons peuvent être des agents pathogènes humains ? Tous les champignons peuvent probablement potentiellement être nocif, à cet égard, si votre système immunitaire a été compromis. Heureusement, pour la plupart d'entre nous, ce n'est pas un problème et la probabilité de contracter une maladie fongique grave est faible par rapport aux maladies bactériennes ou virales. Cependant, ces dernières années, il est devenu plus problématique avec le nombre croissant de personnes dont le système immunitaire est affaibli, comme les personnes atteintes du sida, les transplantations d'organes, le diabète et le traitement de diverses formes de cancer.

Certains agents pathogènes humains fongiques

En discutant des maladies fongiques, la façon la plus pratique de les classer est de les catégoriser selon le type d'infection qui s'est produite : 1. Infections superficielles, sont causées par des champignons qui attaquent la peau ou ses phanères (ongles, plumes et cheveux). Quelques exemples de ces infections incluent les teignes, les démangeaisons et le pied d'athlète. Ces champignons sont connus sous le nom de dermatophytes. 2. Systémique infections, maladies qui se produisent profondément dans les tissus, impliquant des organes vitaux et/ou le système nerveux, et qui peuvent être mortelles, mais peuvent également être chroniques. L'entrée dans le corps se fait généralement par inhalation de spores ou de plaies ouvertes. La circulation sanguine ou le système respiratoire peuvent alors transmettre des champignons dans tout le corps et une infection supplémentaire des organes internes peut survenir. Ces champignons, sont généralement des champignons saprotrophes, poussant dans le sol. Un tiers, Infection intermédiaire, est parfois également reconnu et est intermédiaire entre les deux qui viennent d'être discutés. L'infection se produira sous la peau, mais restera localisée

Infections superficielles

Les mycoses superficielles sont les plus connues car facilement observables. Ils se produisent généralement sur les cheveux, les ongles et la peau des personnes infectées. Ils ont été enregistrés dans diverses compilations de la littérature médicale depuis plus de mille ans sous le nom de ver anneau, pied d'athlète, démangeaison et piedra. Pour chaque type d'infection, il peut également y avoir une variété d'espèces qui peuvent être à l'origine de la maladie. Ainsi, nous n'aurons qu'une discussion générale sur ce groupe de maladies.

Teigne et dermatophytes apparentés

La teigne se produit généralement sur les parties exposées du corps, formant des excroissances circulaires qui peuvent apparaître plus foncées ou plus claires que la couleur normale de la peau, avec des symptômes qui incluent des lésions cutanées, des éruptions cutanées et des démangeaisons de la zone infectée. Les infections par la teigne sont courantes là où les conditions sont insalubres et surpeuplées et sont connues depuis le début de l'histoire. Il y a des indications que la teigne était plus répandue dans un passé récent qu'aujourd'hui en raison de l'amélioration des conditions sanitaires et des habitudes de santé. Les Grecs l'appelaient Herpès (=forme circulaire ou annulaire) et les Romains associaient la maladie au stade larvaire de Tinea, le genre de la mite des vêtements. Les deux noms ont finalement été combinés en "ringworm". Bien que la cause réelle de la teigne n'ait été connue qu'au début des années 1800, la pratique consistant à séparer les individus infectés pour empêcher la propagation de la maladie indiquait que l'on savait que cette maladie était contagieuse et répandue, et qu'elle pouvait se transmettre d'une personne à l'autre. à la cause de l'infection.

C'est Gruby qui a isolé et décrit l'un des champignons de la teigne, Trichophyton, signifiant "plante à fil", et grâce à l'inoculation sur des parties saines du cuir chevelu, a pu reproduire la maladie. Il a également effectué la même expérience avec plusieurs autres champignons pathogènes humains et s'est inoculé avec le pathogène, ainsi que d'autres. Bien que ce soit une grande réussite, Gruby a également eu beaucoup de chance car, à l'époque, l'isolement de champignons spécifiques n'était pas une pratique courante, et c'était également 30 ans avant le développement de techniques pour cultiver des champignons et des bactéries en culture pure. .

Selon Ainsworth, plus de 350 espèces de dermatophytes ont été proposées et ont donné environ 1 000 noms, ce qui a causé une certaine confusion en mycologie médicale. La prolifération des noms est due au fait que différents chercheurs ont travaillé avec la même espèce d'agent pathogène, dans un lieu et à une époque différents, et chacun connaissait cet isolat particulier de cette espèce particulière de champignon et n'était probablement pas trop familier avec cet isolat. Ils l'ont cultivé brièvement dans la culture et l'ont publié. Ainsi, chaque champignon dermatophytique nouvellement isolé a reçu un nom, parfois selon les symptômes auxquels il était associé ou selon la partie du corps atteinte, c'est-à-dire le haut de la tête, le cou, le visage, la main, le bras, la jambe et le pied, voire la région géographique, ou parfois juste pour des raisons de publication (en raison de la compétitivité des facultés de médecine) . Cela a conduit à une grande confusion dans la compréhension des mycoses.

Bien que les premières espèces aient été décrites dans les années 1840, elles ont été peu étudiées jusqu'aux années 1940, lorsque les militaires américains, alors qu'ils combattaient dans le Pacifique Sud, pendant la Seconde Guerre mondiale, contractèrent la teigne et d'autres champignons sous les tropiques humides (un exemple d'avancement de connaissances grâce à la recherche dirigée). Cela a conduit à une étude intensive, par le gouvernement de ces champignons avec de nombreuses espèces réduites à des synonymes. Par exemple, 172 espèces ont été réduites à Candida albicans.

Épidémiologie de la teigne

  1. Zoophile ou « aimer les animaux ». Les espèces infectent principalement les animaux, par ex. chats, chiens, chevaux, vaches, volailles, mais peut être facilement transmis à l'homme. C'est probablement la source la plus courante de teigne chez les humains, et elle est généralement causée par Microsporum canis, une espèce que l'on trouve généralement sur les chats et les chiens. Les animaux porteurs de la teigne ne présentent pas nécessairement des signes extérieurs de la maladie. Les animaux asymptomatiques et probablement les humains aussi sont porteurs de ces maladies. Les infections se propagent principalement par les spores, mais des fragments mycéliens de la peau et des cheveux peuvent vraisemblablement également se produire. Les spores ont une très longue durée de vie et peuvent rester vivantes pendant des années dans les couvertures, les vêtements, la literie, les peignes et autres outils de toilettage.
  2. anthropophile ou "aimer l'homme". Les espèces infectent les humains et ne peuvent pas être transférées aux animaux.
  3. Géophilique ou "amoureux de la terre". Un autre mot ce sont des parasites facultatifs !

Il doit y avoir de grandes différences entre les individus dans la sensibilité à l'infection de ces champignons de la teigne ainsi que de grandes différences dans la sensibilité d'un individu à différents moments. De nombreuses questions restent sans réponse concernant cette espèce à l'origine des différentes formes de teigne.

Les infections par la teigne sont commodément divisées en catégories, en fonction de la partie du corps qui a été infectée :

  • Teigne: Teigne du cuir chevelu, des sourcils et des cils.
  • Tinea corporis: Teigne du corps.
  • Tinea cruris: Teigne de l'aine, du périnée et de la région périanale. Les infections sont communément appelées "eczéma marginé".
  • Tinea unguium: Teigne de l'ongle.
  • Tinea barbae: Teigne de la barbe.
  • Pied d'athlète: Teigne des pieds. Les infections sont communément appelées pied d'athlète.
  • Tinea manuum: Teigne de la main.
Image de gauche : Exemple de Tinea capitis. Image du milieu : exemple de Tinea corporis. Image de droite : exemple de Tinea pedis (pied d'athlète). Toutes les images sont une gracieuseté du Dr Glenn Bulmer, de http://www.medicalmycology.net.

Notez que les différents noms "Tinea" donnés aux différentes formes de teignes ne constituent pas des noms d'espèces. Un résumé des maladies de la teigne ci-dessus, basé sur les emplacements anatomiques peut être trouvé sur le Informations sur la santé Medline Plus. Il y a aussi une discussion sur le traitement des différents types de teignes qui ont été omis sur cette page Web. Attention, ce site a des graphismes très explicites de ces maladies !

Vraisemblablement, l'infection se propage principalement par des spores en suspension dans l'air, c'est pourquoi les vétérinaires ne veulent pas que les animaux infectés par la teigne restent dans leurs cliniques ou hôpitaux. Si tel est le cas, nous devons tous être exposés à un moment donné à des infections par divers champignons de la teigne. Pourquoi est-ce alors que peu d'entre nous sont infectés ? Pourquoi l'infection est-elle généralement localisée, par ex. la teigne du cuir chevelu ne se produit que dans partie alors que la plupart des zones ne sont pas affectées ? Certes, il y a suffisamment de spores produites pour que tout le cuir chevelu soit infecté. Parfois, une personne dans une famille ou un animal dans un troupeau attrape la teigne et elle ne se propage pas aux autres, alors que d'autres fois, elle est très contagieuse. Il y a beaucoup à apprendre sur la teigne.

Une maladie intéressante qui ne fait pas partie des teignes est la piedra. Il s'agit d'une maladie des cheveux où le mycélium se développe le long de la tige du cheveu et fusionne souvent des touffes de cheveux. Se produit généralement dans des conditions insalubres, dans les pays tropicaux. Pour traiter la piedra, les cheveux infectés sont coupés ou rasés et une crème topique à base d'azole, d'acide salycylique ou de formaldéhyde à 2 % est appliquée sur la zone touchée.

Mycoses systémiques ou profondes

Il existe une douzaine ou plus d'espèces de champignons causant diverses mycoses systémiques ou profondes chez l'homme et l'animal. Nous discuterons de plusieurs des espèces les plus répandues ou en raison d'un aspect intéressant du champignon ou de la maladie.

Coccidioïdes immitis, la cause de la coccidioïdomycose (fièvre de la vallée)

Cette espèce est endémique au sud-ouest, aux États-Unis (Californie, vers l'est en passant par l'Arizona, le Nouveau-Mexique et la moitié ouest du Texas), le nord du Mexique et certaines régions d'Amérique centrale et du Sud. Aux États-Unis, il est le plus souvent enregistré dans le comté de Kern, dans la vallée de San Joaquin en Californie. L'infection peut survenir après un voyage dans l'une des zones d'endémie. Le premier cas de coccidioïdomycose a été décrit en Argentine peu avant 1890, le patient a souffert pendant sept ans avant de mourir définitivement et en 1915, il y avait 40 cas connus de cette maladie, considérée comme rare et universellement mortelle. Cependant, à ce moment-là, on savait déjà qu'il y avait une maladie appelée Valley Fever, qui n'était pas associée, à cette époque, à C. immitis. Ce n'est qu'après Dickson (1937) qu'on s'est rendu compte que la fièvre de la vallée n'était qu'une forme plus légère de coccidioïdomycose. Dickson & Gifford (1938) l'exécution coccidioïdine test cutané des résidents de longue date du comté de Kern ont démontré que 50 à 70 % ont, à un moment donné, été infectés par ce champignon. Le test est comme un test de tuberculose (TB) où des substances appelées antigènes qui sont associées à la maladie sont injectées juste sous la peau, de votre avant-bras, et les résultats sont lus 24 à 48 heures plus tard. Si une infection de C. immitis s'est produit, des anticorps seront produits par le corps qui réagiront avec l'antigène qui a été injecté, provoquant un gros gonflement rouge dans la zone d'injection.

Coccidioïdes immitis est contracté par inhalation de spores et provoque principalement une maladie respiratoire chez les animaux et les humains, mais à partir des poumons, il peut se propager dans tout le corps par la circulation sanguine et provoquer des changements pathologiques - des lésions cutanées d'une sorte ou d'une autre - dans à peu près tous les tissus dans toutes les parties du corps. Dans le cours habituel des événements, l'infection entraîne une maladie respiratoire plus ou moins aiguë mais bénigne et spontanément résolutive, mais une fois que le patient s'en remet, il est susceptible d'être définitivement immunisé contre une nouvelle infection. Fiese (1958), une autorité sur cette maladie, dit qu'environ 60 % des personnes infectées ont peu ou pas de symptômes, et 40 % ont des symptômes de divers degrés de gravité frissons, fièvre, douleurs thoraciques, toux, lassitude - symptômes typiques d'un une douzaine d'autres infections aussi. Ces symptômes se développent dix à quatorze jours après l'infection et peuvent persister pendant un certain temps, mais finalement, dans la plupart des cas, les processus immunologiques du corps prennent le relais et le débarrassent de l'infection, bien que des lésions et des cicatrices dans les poumons puissent subsister. Dans relativement peu de cas (1 sur 500), le champignon est disséminé des poumons vers d'autres parties du corps, et ce stade secondaire peut entraîner des lésions sévères de la peau, des os et des organes internes et la victime aura des lésions externes et externes massives. lésions internes et abcès. Si ce stade est atteint, il est peu probable que la victime se rétablisse, la mort surviendra en quelques semaines ou après une maladie longue et persistante. Parfois, la maladie atteint un stade assez avancé, puis reste statique pendant des années, et elle peut régresser et réapparaître plus tard. L'amphotéricine B est le médicament de choix pour traiter cette maladie.

Image de gauche : réaction positive au test cutané à la coccidioïdine. Image du milieu : Lésions cutanées dues à une infection à C. immitis, tirée de http://drugster.info/img/ail/1899_1911_2.jpg. Image de droite : Lésion cutanée due à une infection à C. immitis sur le visage, avec l'aimable autorisation de Glenn Bulmer.

Histoplasma capsulatum et Histoplasmose

L'histoplasmose survient chez les humains et les chiens, elle s'est rarement produite chez d'autres animaux domestiques ou sauvages. L'infection se produit par inhalation de spores de ce champignon. L'histoire de cette maladie est similaire à celle de la coccidiomycose. Les trois premiers cas d'histoplasmose ont été décrits dans la zone du canal de Panama en 1905 et 1906. Les patients sont décédés d'infections massives et, lors de l'examen post mortem des tissus malades, on a pensé que la maladie avait été causée par un protozoaire (Darling, 1906). Ainsi, le nom H. capsulatum, qui fait référence à ce que l'on croyait être un plasmodium encapsulé trouvé lors de l'autopsie. Le premier cas survenu aux États-Unis a été enregistré en 1926 et en 1934, seuls six cas avaient été décrits au Panama et aux États-Unis, tous post mortem.

Jusqu'en 1940, l'histoplasmose était considérée comme une maladie rare et presque invariablement mortelle, et on y prêtait peu d'attention. Cependant, en 1940, de nombreux hommes qui ont subi des radiographies pulmonaires dans le cadre de leur examen physique pour déterminer leur aptitude au service militaire, se sont avérés avoir des lésions pulmonaires calcifiées indiquant des infections guéries, ce qui est normalement un test positif pour la tuberculose. . L'incidence de ces lésions était particulièrement élevée chez les hommes des vallées du Mississippi et de l'Ohio. Quelques-uns de ces hommes étaient positifs au test tuberculinique et il était donc peu probable que ces lésions soient dues à des infections tuberculeuses. En 1945, Test cutané à l'histoplasmine a révélé qu'un grand nombre de personnes dans certaines régions des États-Unis ont été testées positives pour l'histoplasmose, mais semblaient être en parfaite santé à un moment donné dans le passé avec lesquelles elles avaient été infectées Histoplasma capsulatum (Christie & Peterson, 1945). Il a été estimé que jusqu'à 20% de la population des États-Unis sont ou ont été infectés par ce champignon. The great majority of these either have no symptoms at all or suffer only miscellaneous aches and pains, with a light cough, perhaps some dysentery, very much like symptoms of coccidioidomycosis, flu, and various bacterial infections. The symptoms soon disappear and the individual is then highly resistant or immune from further infection by this fungus.

However, again, in a small percentage of cases the fungus spreads, by way of the blood stream, from the source of the original infection in the lungs throughout the body, and this may result in massive infection that is usually rapid and fatal. Thus, the disease is very widespread, but until 1940, it was thought to be a rare, but fatal disease which was usually not diagnosed until an autopsy was carried out and may not have been recognized even then. More cases probably occurred, but because few pathologists were trained to recognize fungal diseases. Medical mycology was still a little studied area at this time. As was the case in coccidioidomycosis, once the disease has been disseminated from the lungs to the rest of the body, it is likely to be fatal and nothing can be done.

Although there is a high incidence of this disease, it is not communicated from animal to animal or person to person or even animal to people. It seems likely that the infection source is from the soil where it has been demonstrated to exist as a saprobe. However, it apparently does not sporulate in soil, but rather only in droppings of birds and bats. The fungus grows there and presumably sporulates on the droppings. This is the reason that public parks throughout the country do not allow people using the park to feed the birds. Large number of birds feeding in a given area, where there are often a lot of people, would present an environment where there is greater probability that someone may catch this disease.

Although this disease is little known, several years ago, on May 25, 1997, Bob Dylan was hospitalized, with histoplasmosis, although his life was threatened, he apparently was never in danger of dying of this disease. However, the disease became far better known after he contracted it. I was still able to find a brief mention of this news story in the archives of the Los Angeles Times. If you wish to read this article, click here.

Left Image: Histoplasmosis infection of gum, from http://www.doctoribolit.ru/images/Histoplasmosis/Histoplasmosis04.gif. Right Image: Skin lesion of upper lip due to histoplasmosis infection, from Centers for Disease Control and Prevention's Public Health Image Library #6840.

Blastomyces and Blastomycosis

There are two species of this genus, Blastomyces dermatitidis et B. brasiliensis that occur in North America and South America, respectively. These species occur naturally in soil, especially soil in animal habitats. It is apparently widespread in Kentucky and Arkansas where infection in dogs is common. Infection is rare in other animals, but have been recorded in cats, one horse and one sea lion.

Infection apparently comes from spores or mycelium in the soil and any part of the body may be invaded. Infections usually are first detected as skin lesions the lesions may remain localized or may gradually enlarge. In some case the fungus can spread throughout the whole body, resulting in extensive ulceration. Males are infected more frequently than female - in some studies the ratio is 15:1. There is no effective treatment.

Intermediate Infections

These are diseases that are intermediate between the first two categories. These fungal infections may extend to a considerable depth within the tissue, but unlike the systemic diseases will not be distributed to the rest of the body. One of the most common intermediate infection is Candida albicans.

Candida albicans and Candidiasis

Candida albicans is a dimorphic fungus. That is, it grows as both mycelium and yeasts. This is one reason why there were so many names given to this fungus. This fungus normally occurs in the mouth, digestive tract, and vagina of perfectly healthy people, but under some circumstances, and for reasons unknown, it may cause severe and even fatal infections, with lesions and eruptions of the skin, nails, mouth, bronchial tubes and lungs. There are suggestions that there are special strains of this species that are pathogenic. This is suggested by the fact that this disease can be contagious and epidemics have occurred. Predisposition may also play a role in infection. Oral infections known as thrush is relatively common. Infections can occur on various parts of the body.

Candidiasis infections on various parts of body: Left Image: On tongue, commonly referred to as Thrush. Middle Image: On neck. Right Image: Is a case where it is fatal. Lack of T-Cells allowed infection to occur on many parts of body. Images courtesy of Glenn Bulmer, from http://www.medicalmycology.net.

Disease is mostly tropical to subtropical, but was first reported from Boston in 1915 and may be caused by several species of fungi. Species causing this disease are mostly soil inhabiting or on decaying vegetation and typically enter the foot or lower part of the leg through wounds from walking bare-footed. Early treatment involves excision of infected area or cryosurgery. Chemical treatments vary in their success of controlling this disease.

Image de gauche : Fonsecae pedrosoi infection of left leg. Right Image: Same leg after daily treatment with Itraconazole. Images courtesy of Glenn Bulmer, from http://www.medicalmycology.net.

Aspergillus fumigatus and Aspergillosis

Aspergillus fumigatus is a species complex rather than a single species. It is actually composed of ten species. These species are commonly found in decaying vegetation, especially when the latter is undergoing microbiological heating, because this complex is thermophilic, adapted to growing at high temperatures 50 - 55 C (120 -130 F).

Aspergillus fumigatus sometimes parasitizes animals, especially birds, infecting mainly lungs and causing heavy mortality - up to 50% in young turkeys and up to 90% in young chicks. Heavy losses have also been reported in herring gulls, ostriches and diving ducks in the wild and in penguins in zoos. The fungus can also invade the embryos of eggs in incubators, and probably does the same in eggs in nest in the wild. It also invade the uterus of pregnant cattle and grows through the placenta into the fetus, which then dies and is aborted. It has been estimated that 64% of bovine abortion investigated were due to infection of A. fumigatus.

In people, the disease can lead to a chronic lung infection which is apparently very contagious. The fungus is thought to cause death, but that is not certain. In patients that have died and A. fumigatus has been isolated, many have also had underlying disease that possibly lowered their resistance to the fungus. However, it is also possible that the fungus had lowered their resistance to the other infective agents. It is difficult to know what came first.

Human pathogenic then can indeed be very serious and almost any fungus can potentially cause an infection. Although these diseases are not common, there is now a higher incidence of fungal diseases. This is due to the increased number of transplants that are being carried out and to the rise in the number of people afflicted with AIDs. In those individuals requiring transplants in order to be able to continue with a normal life, they must take powerful drugs that suppress the immune system so that the transplanted organ will not be rejected by their body, and of course the immune system of individuals afflicted with AIDs have been comprised by the nature of the disease. With an immune system that has been compromised, there has been a rise in the number of people that have succumbed to fungal diseases.

Unlike bacterial diseases, fungal diseases are more difficult to treat. Often topical and oral treatments are long term and may only be partially successful in controlling the fungus, if they work at all. Many infections will be chronic and if you are fortunate enough to rid the infection from your body, there is always the possibility of recurrence of the disease. Why the difficulty in treating fungal diseases? Many serious bacterial diseases have been successfully treated and usually without side affects from the drugs used. This usually is not the case with treatment of fungal diseases. The reason for this is that fungi, like people, are eukaryotes, making the two types of cells similar, at least more similar than to bacterial cells. There is enough similarity that when attempts are made to rid your body of a fungal infection, with chemicals, it is difficult to find a treatment that can remove the fungus without doing significant damage to your own cells.

Christie, A. & Peterson J. C. 1945. Pulmonary calcification in negative reactors to tuberculin. Am J Public Health. 35:1131.

Darling, S.T. 1906. A protozoan general infection producing pseudo tubercles in the lungs and focal necrosis in the liver, spleen and lymph nodes. JAMA 46,1283-1285

Dickson, E. C. 1937. "Valley fever" of the San Joaquin Vallen and fungus Coccidioides. California West. Med., 47: 151-155.

Dickson, E. C., & Gifford, M. A. 1938. Coccidioides infection (Coccidioidomycosis): the primary type of infection. Cambre. Interne. Med., 62: 853-871.

Edwards, L. B., & Palmer, C. 1957. Prevalence of sensitivity to coccidioidin, with special reference to specific and non-specific reactions to coccidioidin and histoplasmin. Dis. Chest. 31: 35-60.

Fiese, M. J. 1958, Coccidioidomycosis. Charles C. Thomas, Springfield, IL, 253 p.

Hawksworth, D. L. 1992. Fungi: A neglected component of biodiversity crucial to ecosystem function and maintenance. Canadian Biodiversity 1: 4-10.

Hudler, G. W. 1998. Magical Mushrooms, Mischievous Molds. Princeton University Press. Princeton, New Jersey, 248 p.

Lacaz, C. da S., E.M. Heins-Vaccari, N. Takahashi de Melo, and G.L. Hernandez-Arriagada. 1996. Basidiomycosis: a review of the literature. Rev. Inst. Méd. Trop. S. Paulo, 38(5): 379-390.

Speller, D.C.E. and A. G. MacIver. 1970. Endocarditis caused by a Coprinus species: A fungus of the toadstool group. J. Méd. Microbiole. 4:370-374

Kern, M.E. and F.A. Uecker. 1986. Maxillary Sinus Infection Caused by the Homobasidiomycetous Fungus Schizophyllum commune. Journal de microbiologie clinique. 23: 1001-1005.

Rippon, J. W. 1988. Medical Mycology: The Pathogenic Fungi and the Pathogenic Actinomycetes. W. B. Saunders Company Harcourt Brace Jovanovich, Inc. Philadelphia, PA, 797 p.

There are a number of web sites that have concise descriptions of diseases with pictures:

National Center for Mycology: An excellent page for superficial infections, i.e., dermatophytes.

Doctor Fungus: Web site has an excellent medical mycology section, but also has general information about fungi, an image bank, and "sick building syndrome" (a topic we will cover later in the semester).

Anthropophilic: Literarily "man loving." Species infect people and cannot be transferred to animals.

Aspergillosis : Disease caused by Aspergillus fumigatus parasitizes animals, especially birds, infecting mainly lungs, through inhalation of spores, and causing heavy mortality

Blastomycosis : Infection apparently comes from spores or mycelium of Blastomyces dermatitidis et B. brasiliensis, in the soil and any part of the body may become infected through access of wound on body. Infection form lesion that may stay localized, but may spread throughout body forming extensive ulceration.

Candidiasis: Fungal disease caused by Candida albicans. This fungus is found among the normal flora of the mouth, digestive tract, and vagina of perfectly healthy people, but under some circumstances, and for reasons unknown, it may cause severe and even fatal infections, with lesions and eruptions of the skin, nails, mouth, bronchial tubes and lungs.

Chromoblastomycosis: Disease caused by several species of fungi. Species of fungi normally in soil or decaying plant material, and enters the body, usually foot or lower leg, through a break in the skin. Fungus causes a chronic infection in which there are raised crusted lesions affecting the skin and subcutaneous tissue.

Coccidioidomycosis : Systemic mycosis, also known as Valley Fever. Contracted through inhalation of spores of Coccidioides immitis, from soil, causing respiratory problems in animals. However, may spread throughout the body by way of the bloodstream and cause pathologic changes - lesions of one sort or another - in just about all tissues in all parts of the body, and may be fatal in such cases.

Dermatophyte: Fungus that attacks the skin.

Histoplasmosis : Systemic mycosis, usually occurring in people and dogs. Contracted through inhalation of spores of Histoplasma capsulatum, that occur in droppings of birds, and bats as well as other rodents. May only cause respiratory if remaining localized, but if infection spreads through blood stream, it may be fatal.

Intermediate infections: Fungal infections occurring below the skin, but remaining localized.

Geophilic: Literarily "earth loving." Species that occur naturally in soil, presumably as a saprobe, but is capable of infecting animals and people.

Medical Mycology: The study of Fungi as animal and human pathogens.

Mycoses: Diseases of warm blooded animals caused by fungi.

Opportunistic Fungi: These are Fungi that normally do not cause diseases, but if opportunity arises, e.g. compromise immune system or open wound entry, they can cause an infection and often times are fatal. Also referred to as facultative parasites.

Pleomorphism: Ability of fungi to take on different forms.

Teigne: Superficial disease of skin caused by various species of fungi.

Infections superficielles : Fungal infections that attack the skin or appendages (nails and hair).

Systemic infections : Fungal infections that occur deep within the tissues, involving vital organs and/or the nervous system, and which may be fatal, but may also be chronic.

Tinea: Term referring to various roundworm diseases. Used as part of a binomial, but not a species name, to refer to infections to various parts of the body, e.g., Tinea barbae = ringworm of beard, Tinea pedis = ringworm of feet.

Veterinary Mycology: The study of fungi as animal pathogens, such as those of pets and farm animals.

Zoophilic : Literarily animal loving. Said of fungal dermatophytes that infect animals. Diseases can be transmitted from animals to people.


Oomycetes Vs True Fungi: Similarities and Differences: A Comparison Chart

Oomycetes, commonly called as water molds, are a group of fungi with distinct phylogenetic importance. Apart from its phylogenetic importance, Oomycetes are disreputable for their plant pathogenic properties. This group includes the notorious plant pathogen, Phytopthora, which cause late blight of potato, the major culprit in Irish Famine. Even though Oomycetes are traditionally included in the Kingdom Fungi, the current developments in the phylogenetic studies showed that Oomycetes are rather a controversial group which shows more phylogenetic lineage with photosynthetic organisms such as diatoms and brown algae. Morphologically Oomycetes are more allied to the Kingdom Fungi, however, in their phylogeny and physiological features they shows considerable difference from true fungi.

Recent molecular studies using DNA sequencing confirmed that Oomycetes are closely related to algae than true fungi and with this modern evidence, the Oomycetes should be regarded as “incolore” algae rather than true Fungi. In this post we will discuss the similarities and differences of Oomycetes from true fungi which will help you to understand the phylogenetic importance of this group.

Similarities between Oomycetes and true Fungi

Ø Oomycetes and true fungi are eukaryotes

Ø Both Oomycetes and true fungi, the vegetative plant body composed of mycelium formed by organized hyphal networks.

Ø Both Oomycetes and true fungi have heterotrophic mode of nutrition.

Ø Both groups obtain nutrients by absorption

Ø Both groups are devoid of chlorophyll pigments and hence they cannot do photosynthesis.

Ø Both groups include parasitic members

Ø In both groups, cell possess cell wall (the chemical nature of cell wall varies)

Ø Both groups includes flagellated structures (flagellated structures are absent in the higher groups of true fungi)

Ø Both groups undergo sexual reproduction

Ø Both groups produce spores as a mode of reproduction

Difference between Oomycetes and True Fungi

(1). Oomycetes:

1. Neighboring taxonomic group: Based on the phylogenetic analysis with 18S rRNA, oomycetes are more related to Heterokontae which contain diatoms and golden-brown algae

2. Hyphal architecture: Aseptate and coenocytic tubular hyphae

3. Ploidy of vegetative hyphae: Vegetative phase diploid, except for transient haploid nuclei in the gametangia

4. Dikaryotic phase: No dikaryotic phase in the life cycle, gametic nuclei immediately undergo fusion to form diploid zygote

5. Size of genome: Large genome with 50-250 Mb of DNA

6. Cell wall chemistry: Cell wall composed of cellulose and β-1,3 and β-1,6 linked glucose polymers

7. Pigmentation: Usually un-pigmented vegetative and reproductive structures

8. Toxic secondary metabolites: No toxic metabolite has been described so far from Oomycetes

9. Mating hormone: Non-peptide, probably lipid like

10. Predominant sexual spores: Sexual spores are un-desiccated, unicellular sporangia (multinucleate cells)

11. Motile asexual spores: Motile sexual spores are nearly universal in Oomycetes. They are biflagellated zoospores.

12. Oospores: Oomycetes produce oospores during sexual reproduction

13. Sexual spores: Sexual spores are oospores, formed on the terminal or specialized hyphae, each containing one viable zygotic nucleus

14. Major energy reserve: Mycolaminarin is the major food reserve. Lipids and polyphosphate are also food reserves

15. Mitochondria: With tubular cristae

16. Flagella: Heterokont, of two types, one whiplash, directed posteriorly, the other fibrous, ciliated, directed anteriorly

17. Lysine biosynthetic pathway: Different from true fungi, Oomycetes has diaminopimelic acid pathway (DAP) similar to higher plants

(2). True Fungi:

1. Neighboring taxonomic group: Phylogenetic analysis with 18S rRNA showed that true fungi are related to Animals

2. Hyphal architecture: Either single cell or septate hyphae, with one or more nuclei per cell

3. Ploidy of vegetative hyphae: Vegetative phase is typically haploid or dikaryotic often with a stable or semi-stable diploid stage following mating

4. Dikaryotic phase: A prominent dikaryotic phase is present in higher groups (Ascomycetes, Basidiomycetes), gamete nuclei stay together without fusion and they undergo simultaneous division when the cell divides

5. Size of genome: Comparatively small genome with only 10 – 40 Mb

6. Cell wall chemistry: Cell wall primarily composed of chitin (β-1,4 linked N-acetylglucosamine) and/or chitosan (β-1,4 linked glucosamine)

7. Pigmentation: Pigmentation is very common in hyphae or spores. Common pigments are melanin and carotenoids.

8. Toxic secondary metabolites: Toxic metabolites are common in true fungi. They are typically aromatic, heterocyclic compounds or proteins.

9. Mating hormone: Usually small peptides or lipo-peptides

10. Predominant sexual spores: Sexual spores are desiccated single or multicellular conidia (one nucleus per cell)

11. Motile asexual spores: Motile spores are very uncommon in true fungi. They are present only in Chytrids. The zoozpores of Chytrids are monoflagellate

12. Oospores: Oospores are absent in true fungi

13. Sexual spores: Various types of sexual spores are formed in true fungi. They are often formed in large numbers within complex enclosures such as perithecia, apothecia or mushroom caps.

14. Major energy reserve: Glycogen is the primary food reserve. Other food reserves are trehalose, sugar alcohols and lipids

15. Mitochondria: With flattened cristae

16. Flagella: If flagellum produced, usually of only one type: posterior, whiplash

17. Lysine biosynthetic pathway: Different from Oomycetes, True fungi has α-amino adipic acid (AAA) pathway.

A Comparison Chart of Major Difference between Oomycetes and True Fungi


Caractéristiques des champignons

Many of the basic characteristics of fungi were explained above, but there are a few other aspects of this kingdom that make it so unique, and decidedly different from plants and animals.

  • Fungi have cell walls that are made of chitin, unlike plants, whose cell walls are made of cellulose, and animals, which do not possess cell walls at all.
  • Like all living things, fungi store energy for certain metabolic processes, and their main storage molecule is glycogen. This is the same as animals, although plants store their energy in a different molecule &ndash starch.
  • Fungi help to recycle the nutrients of dead organic matter, making those nutrients available to the soil, so that new life can flourish and grow. Without fungi, the nutrient cycle would not function, and life would be unable to thrive.
  • Fungi are able to absorb nutrients directly from other sources because of hyphes &ndash very thin threads that can grow and form a mycelium network.

(Photo Credit : TheAlphaWolf/Wikimedia Commons)

Fungi come in many shapes and sizes, ranging from the microscopic to a massive patch of fungus in Oregon that encompasses an astounding four square miles!


Do all Fungi have similar cells? - La biologie

Introduction aux champignons

In this part of the course, we will be studying the organisms that are referred to as fungi (sing.=fungus). Although you have now studied various groups of plants and algae, as well as other eukaryotic organisms, in other courses, you will find that the fungi are probably the least understood among the eukaryotes. Looking back at my undergraduate career, prior to taking my first mycology class, I had a very negative concept of the fungi. My impression of fungi was that they were disease-causing organisms that were found in unsanitary conditions. Although this impression was not entirely wrong, fungi are so much more than that. They are also very beneficial organisms. We have derived a number of useful antibiotics from them, including the "wonder drug" penicillin. Without fungi, we would not have leavened bread, Roquefort and Camembert cheeses, beer, wine and other alcoholic beverages and some mushrooms, morels and truffles are considered to be delicacies among gourmands. While these aspects of fungi are of interest, they will not be the emphasis on our discussions of fungi. If you are interested in learning about these aspects of fungi, you may go to the Botany 135 home page. The emphasis here, instead, will be to study the relationships of the various groups of fungi and attempt to make sense of their phylogeny.

Classification of Fungi

Once upon a time biologist only recognized two kingdoms: Plante et Animal (this was how organisms were classified when I was an undergraduate). Fungi, as well as bacteria and algae were classified in the plant kingdom under this system and that is the reason that these organisms are traditionally studied in botany. In the case of fungi, MYCOLOGY is that part of botany that studies fungi. Although fungi are no longer classified as plants, there is still good reason to study them in botany. Fungi are most often associated with plants, commonly as decomposers, and pathogens, and as their benefactors, e.g. mycorrhiza, but "What is a fungus?" Based on what your studies on plants, in this course, you know that plants are known to be derived from a single algal ancestor from the algal division: Chlorophyta, i.e. they are monophyletic. Once upon a time, the fungi were also believed to be monophyletic and to be derived from an algal ancestor that lost its ability to photosynthesize. However, over time, with the discovery of new techniques in determining relationships between organisms, it was discovered that the fungi are made up of a polyphyletic group of organisms that, in some cases, are very distantly related to one another. Thus, organisms that we call fungi are not grouped together because they are closely related, but rather because they share a combination of characteristics that we will now go over:

  1. Achlorophyllous: Fungi cannot make their own food like plants. They are heterotrophs and depend upon other organism for their carbon source. Heterotrophs can further be divided into the following categories:
    1. Parasites: Organisms that derives their nutrition from the protoplasm of another organism (=hôte).
    2. Saprobes: Organisms that obtains their carbon source (=food) from the by-products of organisms or dead organisms. However, if the opportunity arises, some saprobes may become parasitic. Such organisms are said to be facultative parasites.
    3. Symbiosis: In the strict sense, this term refers to the habitual "living together" of different species. As such, there are a number of different categories of relationships that may fit under this term. However, we will define it in its most common usage: "The intimate association of two dissimilar organisms in a mutually beneficial relationship, e.g. lichens and mycorrhizae." This type of symbiosis is specifically referred to as a mutualistic symbiosis.
    1. Yeast: Unicellular fungi that reproduce, asexually, par bourgeonnant ou fission (terms to be defined later).
    2. Mycelium: The collective, filamentous strands that make up the fungal thallus. Strands of mycelium is referred to as hyphes (sing.=hypha). Mycelium may be of two types:
      1. Septate: Mycelium that is divided into discreet cells by cell walls that are laid down at regular intervals along the length of the mycelium. These cell walls are called septa (sing.= septum).
      2. cénocytaire: Mycelium that is ne pas divided up by septa and forms a continuous tubular network. Septa, however, are present occasionally, especially where reproductive structures occur and where the cell wall of the mycelium has been compromised.
      1. If the available food that the fungus is using is soluble, i.e. a simple organic compound, such as simple sugars and amino acids, the mycelium or yeast cells can transport the food directly through their cell wall.
      2. If the available food is insoluble, i.e. a large, complex, organic compound, such as lignin, cellulose and pectin, then production the food must first be digested. Digestion is carried out by the production of various enzymes that are substrate specific and will break down insoluble food material to soluble compounds that can be transported through the cell wall. Although this appears to be very different from the way in which we (animals) digest food, it differs only in the sequence of events that takes place. Where we ingest food and then digest it, fungi first digest their food before ingestion.

      In summary then, the organisms that we call fungi represent a heterogenous group, i.e., they are polyphyletic, that are not closely related as you will soon see.

      When I was an undergraduate, organisms that were defined as fungi were heterotrophs, with cell walls, that have filamentous or yeast thalli. Today, fungi that are classified in the Kingdom Mycetae (=true fungi), have a more restrictive set of characteristics: Eukaryotes with cell wall material composed primarily of chitin and derive their nutrition by absorption. Pourquoi le changement ? As with any science discipline, knowledge in mycology is dynamic and we have accumulated a great deal of knowledge about the fungi since I first took mycology 30 years ago. The additional knowledge has led us to change our concepts as to the relationship of those organisms that were classified as fungi. Much of the knowledge that led to these changes began in the early 1960 s, when a great deal of research was carried out in fungal ultrastructure. This was later followed by comparative studies on cell wall biochemistry (Barnicki-Garcia, 1970) and more recently molecular approaches, utilized in studying relationships of organisms, has led to further changes in our concepts as to how we define fungi.

      Another change that occurred during this period of time that affected not only fungi, but also "plants" and "animals" as well. When I was an undergraduate, the classification for plants and animals were very broadly defined. As I mentioned, above, organisms in those days were classified as either plants or animals. Fungi, as well as bacteria and algae were classified in the plant kingdom, based mainly on the presence of a cell wall and the lack of ingestion of food material. Cependant, * Whittaker (1969) erected the five-kingdom system, which is currently still the accepted system of classification of organisms. As a result, the fungi, algae and bacteria were placed in different kingdoms. While, the concepts of the five kingdoms have changed since Whittaker (1969), the classification of organisms into five kingdoms have persisted.

      Although, our definition of a fungus has changed a great deal, by tradition, mycology classes have continued to study the same organisms that have been studied since the 1960 s and earlier. While mycologists have learned a great deal about the fungi in these last 30-35 years, there is still not agreement as to how best to classify the fungi, nor will there likely be any agreement at a later time. Some examples of the more popular classification schemes are reproduced below:

      Ainsworth and Bisby (1971) Bessey (1950) Alexopoulos (1962)
      Royaume Champignons Royaume Plantae
      • Plasmodiophormycetes
      • Chytridiomycetes
      • Hyphochytridiomycetes
      • Oomycètes
      • Chytridiomycetes
      • Hyphochytridiomycetes
      • Oomycètes
      • Zygomycètes
      • Trichomycetes
      • Zygomycètes
      • Trichomycetes
      • Hemiascomycetes
      • Plectomycetes
      • Pyrenomycetes
      • Discomycetes
      • Laboulbenomycetes
      • Loculoascomycetes
      • Hemiascomycetidae
      • Euascomycetidae
        • Plectomycetes
        • Pyrenomycetes
        • Discomycetes
        • Laboulbeniomycetes
        • Teliomycetes
        • Hymenomycetes
          • Phragmobasidiomycetidae
          • Holobaasidiomycetidae
          • Blastomycetes
          • Hyphomycetes
          • Coélomycètes
          • Moniliales
          • Sphaeropsidales
          • Melanconiales

          Over the last ten years, there have a great deal of changes in the concepts of the relationships of the various groups of fungi. The classification below represents one of the more recent systems and is based, in part, on molecular research that has been carried out in recent years. Because of time constraints, not all of the different taxa of "fungi" will be listed below or covered in this course.

          Division: Myxomycota (Currently classified with protozoans)

          The above two divisions have also been placed in a recently erected Kingdom: Stramenopila. This kingdom includes the divisions Phaeophyta and Chrysophyta, which you have already studied in the algae portion of this course

          Kingdom: Myceteae (=Fungi)

          • Class: Ascomycetes
            • Order: Saccharomycetales and Schizosaccharomycetales (Yeast)
            • Order: Eurotiales (Fruiting body a cleistothecium)
            • Order: Sordariales and Xylariales (Fruiting body a perithecium)
            • Order: Pezizales (Fruiting body an apothecium)
            • Order: Dothideales (Fruiting body an ascostroma)
            • Class: Basidiomycetes
              • Order: Agaricales (Mushrooms)
              • Order: Lycoperdales, Phallales and Nidulariales (Puffballs)
              • Order: Aphyllophorales (Polypores)
              • Order: Tremellales, Dacrymycetales and Auriculariales (Jelly Fungi)

              As we study the various groups of fungi, I will attempt to point out the problems in using a classification scheme in a course such as this one where the goal is to study the phylogeny and relationship of the various organisms that we are calling fungi.

              During the final lab in this section of the course, I will bring in several dated textbooks, such as Alexoupolous (1962) and Bessey (1950), which were considered outstanding textbooks for their time. At that time, I want you to compare the concepts of fungi in these books with our present concept. Whenever I look back at these textbooks, it never ceases to amaze me as to how much we have progressed in our knowledge of the fungi. Perhaps, this will also be something that you will appreciate by the end of this section of the course.


              Voir la vidéo: Les champignons sont-ils toxiques au toucher? (Novembre 2022).