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30.8 : Outils et techniques - Biologie

30.8 : Outils et techniques - Biologie


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  • HapMap, un catalogue complet de SNP humains.
  • PLINK, un ensemble d'outils C/C++ GWAS open source qui peut analyser de grands ensembles de données avec des centaines de

    des milliers de marqueurs génotypés pour des milliers d'individus afin d'examiner les voies potentielles.

  • GRASS (Gene set Ridge regression in Association Studies) résume la structure génétique de chaque gène en tant que SNP propres et utilise la régression de crête de groupe pour sélectionner des SNP propres représentatifs pour chaque gène, en évaluant leur association avec le risque de maladie et en réduisant la haute dimensionnalité des données GWAS.
  • GWAMA (Genome-Wide Association Meta-Analysis), effectue une méta-analyse de GWAS de phénotypes dichotomiques ou de traits quantitatifs.


Voir la vidéo: Analyser un document: observer et déduire - SVT - Les Bons Profs (Novembre 2022).