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Hétérochromatine contre euchromatine. Lequel est le plus abondant ?

Hétérochromatine contre euchromatine. Lequel est le plus abondant ?


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Je lisais donc simplement que le fait que l'hétérochromatine ou l'euchromatine soit plus abondante dans une cellule humaine particulière dépend de l'activité de cette cellule. Mais étant donné que la plupart des quelque 25 000 gènes du génome humain sont transcriptionnellement inactifs dans une cellule donnée, comment est-il possible que l'activité cellulaire affecte la structure de la chromatine à un degré qui modifie considérablement l'apparence d'un noyau sur des images microscopiques ? Car, après tout, que la cellule soit active ou non n'affectera que peu la chromatine.

Et puisque la majeure partie du génome est inactive, ne devrait-il pas être sous une forme hétérochromatique, et donc la majeure partie de la chromatine dans une cellule donnée sera de l'hétérochromatine ?

(Je sais que ce n'est pas vrai, mais je me demandais pourquoi)


Le pourcentage d'euchromatine varie selon les types de cellules et les organismes. Il a été démontré que jusqu'à 88 % du génome humain est transcrit ; un phénomène appelé transcription omniprésente [1]. Les cellules hautement spécialisées peuvent avoir un pourcentage plus faible de régions transcrites et chez les femmes, un chromosome X entier est réduit au silence (certaines régions du X réduit au silence présentent une activité transcriptionnelle).

Les régions euchromatiques constituent non seulement les régions géniques, mais aussi les régions intergéniques régulatrices telles que les amplificateurs, les régions de contrôle du locus (LCR), les silencieux, etc. Il a été constaté qu'environ 97 % de ces éléments se situent dans la région d'hypersensibilité à la DNAse (DHS) de la chromatine. [2].

L'hypersensibilité à la DNAse est directement proportionnelle à l'état de la chromatine, de sorte que les régions ouvertes/accessibles sont plus sujettes à la digestion de la DNAse-I. Vous pouvez appeler ces régions euchromatine.

Bien que la densité DHS totale ne soit pas indiquée dans le document [2] ou des données supplémentaires, le projet ENCODE concerné par l'article disposera de toutes les informations détaillées. Vous pouvez trouver ces ensembles de données ici, à partir desquels vous pouvez calculer la distribution de densité DHS pour différents types de cellules. Cependant, la plupart de ces cellules sont en fait des lignées cellulaires et non des tissus primaires.


Voir la vidéo: Heterochromatin vs Euchromatin (Novembre 2022).